Upgrade naar Karmic Koala breekt squashfs

Dit weekend heb ik mijn Crunchbang-installatie op de netbook bijgewerkt naar Karmic Koala. De upgrade zelf ging vlotjes. Ik heb er niet heel de tijd op zitten kijken.

Enkele fragmentjes uit het upgradeproces:

12 pakketten zullen verwijderd worden. 142 nieuwe pakketten zullen geïnstalleerd worden. 741 pakketten zullen een upgrade krijgen.
U moet in totaal 436M downloaden. Deze download duurt met uw verbinding ongeveer 9 minuten.
Het upgraden kan enkele uren in beslag nemen en kan tussentijds niet worden afgebroken.
real    430m39.408s
user      16m4.808s
sys        8m3.086s
Real is zo hoog omdat ik het laten draaien heb terwijl ik naar een film keek.

Helaas, na het rebooten bleek dat ik met een onbruikbaar systeem zit.

General error mounting filesystems.
A maintenance shell will now be started.
CONTROL-D will terminate this shell and re-try.
*gil*
OK, regel 1: DON'T PANIC. Control+D heeft geen enkele zin, want er wordt naar een root wachtwoord gevraagd en zoals we allemaal weten, heeft Ubuntu geen root wachtwoord.

Stap 2: rebooten, op Escape drukken in het Grub-menu, en 'e' om te bewerken. De regel met de kernel vul ik aan zodat er een init bij staat:

kernel  /boot/vmlinuz-2.6.31-14-generic root=LABEL=/ rw init=/bin/bash
Wanneer ik daarmee boot, krijg ik het volgende:
bash: cannot set terminal process group (-1): Inappropriate ioctl for device
bash: no job control in this shell
bash: groups: command not found
root@(none):/#
Nu heb ik tenminste een werkende root shell waarmee ik kan uitvissen wat er aan de hand is.

Ik weet al dat er een probleem is met het mounten van een filesystem, maar welk? Het handmatig proberen mounten van alle filesystems gaf meteen het antwoord:

root@(none):/# mount -a
mount: special device LABEL=/home does not exist
[  282.714817] squashfs: version 4.0 (2009/01/31) Philip Lougher
[  282.720623] SQUASHFS error: Major/Minor mismatch, older Squashfs 3.1 filesystems are unsupported
mount: wrong fs type, bad option, bad superblock on /dev/loop0,
       missing codepage or helper program, or other error
       In some cases useful info is found in syslog - try
       dmesg | tail  or so
 
mount: unknown filesystem type 'unionfs'
Aha! Eerst eventjes doen wat er in de foutmelding staat:
root@(none):/ dmesg
[  282.714817] squashfs: version 4.0 (2009/01/31) Philip Lougher
[  282.720623] SQUASHFS error: Major/Minor mismatch, older Squashfs 3.1 filesystems are unsupported
Het probleem is dus duidelijk: bij de overgang van Jaunty naar Karmic, is Squashfs van versie 3.1 naar 4.0 gegaan, en de nieuwe versie is niet backwards compatibel met de oude versie.

Er zit nu niets anders op dan het gesquashte filesystem te unsquashen met de oude versie, en eventueel daarna opnieuw te squashen met de nieuwe versie. Maar hoe? Ik zit met een gebroken systeem.

Gelukkig komt daar weer mijn trouwe usb-stick de redding brengen. Daar stond nog altijd Crunchbang op, van toen ik het geïnstalleerd heb. Maar in principe kan om het even welke andere 9.04 Ubuntu ISO gedownload worden. Die moet dan op de usb-stick gezet worden met unetbootin.

Wanneer Ubuntu 9.04 geboot is vanaf de usb-stick, geef ik volgende commando's:

sudo -i
aptitude install squashfs-tools
modprobe squashfs
modprobe unionfs
mount /dev/sda1 /mnt
mkdir /mnt/usr.old
mount -t squashfs -o ro,loop,nodev /mnt/.filesystems/usr/usr.sqfs /mnt/usr.old
mount -t unionfs -o nodev,noatime,dirs=/mnt/.filesystems/usr/overlay=rw:/mnt/usr.old=ro unionfs /mnt/usr.old
time rsync -av /mnt/usr.old/ /mnt/usr
Het kopiëren nam wel een minuutje of 20 in beslag:
sent 1466696143 bytes  received 1438136 bytes  1256426.43 bytes/sec
total size is 1461396353  speedup is 1.00
rsync warning: some files vanished before they could be transferred (code 24) at main.c(1058) [sender=3.0.5]
 
real	19m28.192s
user	0m51.755s
sys	2m10.544s
Wat die melding over vanished files wil zeggen, weet ik nog niet, maar ik ga er mij ook geen zorgen over maken. Wanneer ik rsync nog eens uitvoer, krijg ik dit:
sending incremental file list
file has vanished: "/mnt/usr.old/lib/graphviz/config4"
 
sent 2434876 bytes  received 9508 bytes  212555.13 bytes/sec
total size is 1461396353  speedup is 597.86
rsync warning: some files vanished before they could be transferred (code 24) at main.c(1058) [sender=3.0.5]
 
real	0m10.500s
user	0m2.820s
sys	0m9.461s
In het slechtste geval is er dus iets mis met graphviz. Niets dat een herinstallatie van het pakket niet kan oplossen.

In /mnt/etc/fstab moeten ook nog (tijdelijk) 2 regels in commentaar gezet worden:

#/.filesystems/usr/usr.sqfs /usr squashfs ro,loop,nodev  0       0
#unionfs         /usr            unionfs nodev,noatime,dirs=/.filesystems/usr/overlay=rw:/usr=ro 0 0
Op die manier gaat Ubuntu niet meer proberen om het squashfs-filesystem te mounten.

Nu is het tijd voor een reboot. Werkt het nu? Neen... *gil*
Ok, opnieuw: DON'T PANIC. Wat is het probleem?

One or more of the mounts listed in /etc/fstab cannot yet be mounted:
(ESC for recovery shell)
/: waiting for /dev/disk/by-label/\134x2f
/home: waiting for /dev/disk/by-label/\x2fhome
Mijn eerste reactie is: onze Koala kan niet overweg met disklabels waar een / in staat. Dat heb ik oorspronkelijk wel gedaan bij het partitioneren. Het gemakkelijkste om de disklabels te hernoemen, is om opnieuw te booten met de usb-stick.
sudo e2label /dev/sda1 root
sudo e2label /dev/mmcblk0 home
/etc/fstab moet ook nog overeenkomstig aangepast worden. Let op: de /etc/fstab op /dev/sda1, dus eerst mounten op /mnt en dan /mnt/etc/fstab aanpassen. De nieuwe versie van /etc/fstab is nu:
# <file system> <mount point>   <type>  <options>       <dump>  <pass>
proc            /proc           proc    defaults               
LABEL=root      /               ext4    noatime,errors=remount-ro        1
LABEL=home      /home           ext4    noatime                2
LABEL=swap      none            swap    sw                     
tmpfs           /tmp            tmpfs   defaults               
tmpfs           /var/tmp        tmpfs   defaults               
tmpfs           /var/cache/apt/archives tmpfs  defaults        
 
# /.filesystems/usr/usr.sqfs /usr squashfs ro,loop,nodev  
# unionfs /usr unionfs nodev,noatime,dirs=/.filesystems/usr/overlay=rw:/usr=ro
Ook in /boot/grub/menu.lst moet nog aangepast worden dat het root device nu niet / maar root heet. This is left as an excercise to the reader...

Ik ben blij dat het bij mij

Ik ben blij dat het bij mij allemaal zonder problemen ging, die upgrade.. Ik werk nog niet zo lang op ubuntu/linux in het algemeen, en zou dus begot niet weten wat te doen.. Het enige gezever dat ik heb is een error als ik 9.10 met de laatste kernelversie selecteer in Grub2, maar vervolgens boot hij toch gewoon..

Zeer interessante post.

Hmmm ja Grub2 da's nog

Hmmm ja Grub2 da's nog zoiets, ik heb natuurlijk nog altijd de oude grub. Allé hop ik heb weer materiaal voor een volgende blogpost Nose Smile

Grub2 staat er nu op. Geen

Grub2 staat er nu op.
Geen enkel probleem, gewoon grub-pc installeren.

Nieuwe reactie inzenden

  • Textual smileys will be replaced with graphical ones.
  • Toegelaten HTML-tags: <a> <em> <strong> <cite> <code> <ul> <ol> <li> <dl> <dt> <dd> <img> <strike>
  • You can enable syntax highlighting of source code with the following tags: <code>, <blockcode>. The supported tag styles are: <foo>, [foo], [[foo]].
  • Adressen van webpagina's en e-mailadressen worden automatisch naar links omgezet.
  • Each email address will be obfuscated in a human readable fashion or (if JavaScript is enabled) replaced with a spamproof clickable link.
  • You may quote other posts using [quote] tags.
  • Regels en paragrafen worden automatisch gesplitst.